Protein–RNA interactions for Protein: O43812

DUX1, Double homeobox protein 1, humanhuman

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX1O43812 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DUX1O43812 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
DUX1O43812 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
DUX1O43812 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DUX1O43812 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DUX1O43812 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DUX1O43812 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DUX1O43812 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DUX1O43812 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DUX1O43812 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DUX1O43812 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DUX1O43812 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DUX1O43812 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DUX1O43812 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DUX1O43812 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DUX1O43812 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DUX1O43812 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DUX1O43812 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DUX1O43812 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DUX1O43812 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DUX1O43812 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DUX1O43812 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
DUX1O43812 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
DUX1O43812 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
DUX1O43812 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX1O43812 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX1O43812 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX1O43812 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX1O43812 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX1O43812 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX1O43812 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX1O43812 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX1O43812 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX1O43812 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX1O43812 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX1O43812 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX1O43812 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX1O43812 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX1O43812 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX1O43812 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX1O43812 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX1O43812 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX1O43812 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX1O43812 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX1O43812 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX1O43812 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX1O43812 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX1O43812 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX1O43812 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX1O43812 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX1O43812 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX1O43812 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX1O43812 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX1O43812 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX1O43812 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX1O43812 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX1O43812 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX1O43812 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX1O43812 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX1O43812 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX1O43812 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX1O43812 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX1O43812 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX1O43812 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX1O43812 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX1O43812 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX1O43812 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX1O43812 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX1O43812 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX1O43812 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX1O43812 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX1O43812 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX1O43812 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX1O43812 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX1O43812 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX1O43812 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX1O43812 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX1O43812 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX1O43812 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX1O43812 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX1O43812 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX1O43812 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX1O43812 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX1O43812 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX1O43812 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX1O43812 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX1O43812 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX1O43812 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX1O43812 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DUX1O43812 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DUX1O43812 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DUX1O43812 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DUX1O43812 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DUX1O43812 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DUX1O43812 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DUX1O43812 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DUX1O43812 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DUX1O43812 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DUX1O43812 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
DUX1O43812 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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