Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD6O43541 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD6O43541 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD6O43541 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD6O43541 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD6O43541 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD6O43541 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD6O43541 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD6O43541 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD6O43541 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD6O43541 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD6O43541 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD6O43541 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms