Protein–RNA interactions for Protein: O15079

SNPH, Syntaphilin, humanhuman

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Length 494 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNPHO15079 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SNPHO15079 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SNPHO15079 CDKN2B-AS_3.1-201ENST00000617587 144 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SNPHO15079 AC106730.3-201ENST00000624568 641 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SNPHO15079 AC022919.1-201ENST00000624979 626 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SNPHO15079 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SNPHO15079 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNPHO15079 AL732372.1-203ENST00000635159 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNPHO15079 AC134980.1-214ENST00000638815 687 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNPHO15079 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNPHO15079 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNPHO15079 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNPHO15079 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNPHO15079 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SNPHO15079 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNPHO15079 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNPHO15079 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNPHO15079 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNPHO15079 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNPHO15079 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNPHO15079 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNPHO15079 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNPHO15079 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNPHO15079 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SNPHO15079 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNPHO15079 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNPHO15079 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNPHO15079 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNPHO15079 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNPHO15079 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNPHO15079 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNPHO15079 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNPHO15079 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNPHO15079 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNPHO15079 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNPHO15079 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNPHO15079 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNPHO15079 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNPHO15079 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNPHO15079 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNPHO15079 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNPHO15079 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNPHO15079 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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SNPHO15079 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNPHO15079 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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SNPHO15079 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNPHO15079 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SNPHO15079 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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SNPHO15079 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNPHO15079 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNPHO15079 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNPHO15079 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNPHO15079 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNPHO15079 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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SNPHO15079 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNPHO15079 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNPHO15079 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNPHO15079 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNPHO15079 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNPHO15079 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNPHO15079 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNPHO15079 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNPHO15079 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNPHO15079 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNPHO15079 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNPHO15079 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNPHO15079 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNPHO15079 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNPHO15079 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNPHO15079 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNPHO15079 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNPHO15079 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNPHO15079 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNPHO15079 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNPHO15079 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNPHO15079 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNPHO15079 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNPHO15079 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNPHO15079 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNPHO15079 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNPHO15079 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNPHO15079 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNPHO15079 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNPHO15079 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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