Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.3 ms