Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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C9orf172C9J069 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
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C9orf172C9J069 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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C9orf172C9J069 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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C9orf172C9J069 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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C9orf172C9J069 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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C9orf172C9J069 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
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C9orf172C9J069 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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C9orf172C9J069 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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