Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms