Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms