Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A0MS04

TRBV6-7, T-cell receptor beta variable 6-7 (non-functional) (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV6-7A0A0A0MS04 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV6-7A0A0A0MS04 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV6-7A0A0A0MS04 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV6-7A0A0A0MS04 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV6-7A0A0A0MS04 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV6-7A0A0A0MS04 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV6-7A0A0A0MS04 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV6-7A0A0A0MS04 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV6-7A0A0A0MS04 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV6-7A0A0A0MS04 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV6-7A0A0A0MS04 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV6-7A0A0A0MS04 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV6-7A0A0A0MS04 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV6-7A0A0A0MS04 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV6-7A0A0A0MS04 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV6-7A0A0A0MS04 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV6-7A0A0A0MS04 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV6-7A0A0A0MS04 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV6-7A0A0A0MS04 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV6-7A0A0A0MS04 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV6-7A0A0A0MS04 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV6-7A0A0A0MS04 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV6-7A0A0A0MS04 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV6-7A0A0A0MS04 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV6-7A0A0A0MS04 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV6-7A0A0A0MS04 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV6-7A0A0A0MS04 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV6-7A0A0A0MS04 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV6-7A0A0A0MS04 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV6-7A0A0A0MS04 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV6-7A0A0A0MS04 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV6-7A0A0A0MS04 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV6-7A0A0A0MS04 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV6-7A0A0A0MS04 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV6-7A0A0A0MS04 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV6-7A0A0A0MS04 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV6-7A0A0A0MS04 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV6-7A0A0A0MS04 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
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TRBV6-7A0A0A0MS04 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV6-7A0A0A0MS04 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV6-7A0A0A0MS04 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV6-7A0A0A0MS04 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
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TRBV6-7A0A0A0MS04 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV6-7A0A0A0MS04 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV6-7A0A0A0MS04 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV6-7A0A0A0MS04 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV6-7A0A0A0MS04 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
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TRBV6-7A0A0A0MS04 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV6-7A0A0A0MS04 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV6-7A0A0A0MS04 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV6-7A0A0A0MS04 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
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TRBV6-7A0A0A0MS04 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV6-7A0A0A0MS04 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV6-7A0A0A0MS04 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV6-7A0A0A0MS04 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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TRBV6-7A0A0A0MS04 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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TRBV6-7A0A0A0MS04 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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TRBV6-7A0A0A0MS04 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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TRBV6-7A0A0A0MS04 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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TRBV6-7A0A0A0MS04 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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TRBV6-7A0A0A0MS04 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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TRBV6-7A0A0A0MS04 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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TRBV6-7A0A0A0MS04 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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