Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms