Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X3

CCL27, C-C motif chemokine 27, humanhuman

Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL27Q9Y4X3 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms