Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPM6

LHX6, LIM/homeobox protein Lhx6, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX6Q9UPM6 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LHX6Q9UPM6 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LHX6Q9UPM6 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LHX6Q9UPM6 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LHX6Q9UPM6 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LHX6Q9UPM6 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LHX6Q9UPM6 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LHX6Q9UPM6 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LHX6Q9UPM6 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LHX6Q9UPM6 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LHX6Q9UPM6 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LHX6Q9UPM6 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LHX6Q9UPM6 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LHX6Q9UPM6 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LHX6Q9UPM6 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LHX6Q9UPM6 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LHX6Q9UPM6 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LHX6Q9UPM6 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LHX6Q9UPM6 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LHX6Q9UPM6 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LHX6Q9UPM6 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LHX6Q9UPM6 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LHX6Q9UPM6 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LHX6Q9UPM6 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LHX6Q9UPM6 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LHX6Q9UPM6 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LHX6Q9UPM6 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LHX6Q9UPM6 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LHX6Q9UPM6 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LHX6Q9UPM6 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LHX6Q9UPM6 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LHX6Q9UPM6 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LHX6Q9UPM6 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LHX6Q9UPM6 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LHX6Q9UPM6 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LHX6Q9UPM6 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LHX6Q9UPM6 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LHX6Q9UPM6 AC012513.1-201ENST00000417481 784 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LHX6Q9UPM6 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LHX6Q9UPM6 AC006455.6-201ENST00000426192 893 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LHX6Q9UPM6 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
LHX6Q9UPM6 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LHX6Q9UPM6 RPS3AP29-201ENST00000437728 769 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LHX6Q9UPM6 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
LHX6Q9UPM6 CFHR2-203ENST00000476712 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
LHX6Q9UPM6 AC139491.3-201ENST00000509643 684 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
LHX6Q9UPM6 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LHX6Q9UPM6 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LHX6Q9UPM6 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LHX6Q9UPM6 AC140125.1-201ENST00000515739 684 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LHX6Q9UPM6 LYRM2-204ENST00000520441 791 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
LHX6Q9UPM6 AC079296.1-202ENST00000521394 960 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
LHX6Q9UPM6 AC022784.5-201ENST00000522241 437 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LHX6Q9UPM6 ZNF826P-202ENST00000542380 1067 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LHX6Q9UPM6 AC129507.2-201ENST00000572499 748 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
LHX6Q9UPM6 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
LHX6Q9UPM6 AL034374.2-201ENST00000605281 548 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LHX6Q9UPM6 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LHX6Q9UPM6 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LHX6Q9UPM6 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
LHX6Q9UPM6 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LHX6Q9UPM6 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LHX6Q9UPM6 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LHX6Q9UPM6 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LHX6Q9UPM6 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LHX6Q9UPM6 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LHX6Q9UPM6 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LHX6Q9UPM6 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LHX6Q9UPM6 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LHX6Q9UPM6 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
LHX6Q9UPM6 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LHX6Q9UPM6 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LHX6Q9UPM6 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
LHX6Q9UPM6 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LHX6Q9UPM6 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LHX6Q9UPM6 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LHX6Q9UPM6 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LHX6Q9UPM6 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LHX6Q9UPM6 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LHX6Q9UPM6 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LHX6Q9UPM6 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LHX6Q9UPM6 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LHX6Q9UPM6 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LHX6Q9UPM6 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LHX6Q9UPM6 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LHX6Q9UPM6 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LHX6Q9UPM6 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LHX6Q9UPM6 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LHX6Q9UPM6 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LHX6Q9UPM6 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LHX6Q9UPM6 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LHX6Q9UPM6 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LHX6Q9UPM6 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LHX6Q9UPM6 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LHX6Q9UPM6 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LHX6Q9UPM6 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LHX6Q9UPM6 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LHX6Q9UPM6 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LHX6Q9UPM6 AC019070.1-201ENST00000415008 1024 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
LHX6Q9UPM6 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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