Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms