Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms