Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
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