Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
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