Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

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Length 571 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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