Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms