Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms