Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.7 ms