Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.4 ms