Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNS3Q9BQ31 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNS3Q9BQ31 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNS3Q9BQ31 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNS3Q9BQ31 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNS3Q9BQ31 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNS3Q9BQ31 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNS3Q9BQ31 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNS3Q9BQ31 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNS3Q9BQ31 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNS3Q9BQ31 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNS3Q9BQ31 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNS3Q9BQ31 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNS3Q9BQ31 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNS3Q9BQ31 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNS3Q9BQ31 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNS3Q9BQ31 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNS3Q9BQ31 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNS3Q9BQ31 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNS3Q9BQ31 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNS3Q9BQ31 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNS3Q9BQ31 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNS3Q9BQ31 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNS3Q9BQ31 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNS3Q9BQ31 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNS3Q9BQ31 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNS3Q9BQ31 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNS3Q9BQ31 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNS3Q9BQ31 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNS3Q9BQ31 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNS3Q9BQ31 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNS3Q9BQ31 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNS3Q9BQ31 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNS3Q9BQ31 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNS3Q9BQ31 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNS3Q9BQ31 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNS3Q9BQ31 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNS3Q9BQ31 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNS3Q9BQ31 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNS3Q9BQ31 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNS3Q9BQ31 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNS3Q9BQ31 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNS3Q9BQ31 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNS3Q9BQ31 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNS3Q9BQ31 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNS3Q9BQ31 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNS3Q9BQ31 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNS3Q9BQ31 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNS3Q9BQ31 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNS3Q9BQ31 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNS3Q9BQ31 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNS3Q9BQ31 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNS3Q9BQ31 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNS3Q9BQ31 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNS3Q9BQ31 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNS3Q9BQ31 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNS3Q9BQ31 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNS3Q9BQ31 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNS3Q9BQ31 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNS3Q9BQ31 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNS3Q9BQ31 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNS3Q9BQ31 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNS3Q9BQ31 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNS3Q9BQ31 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNS3Q9BQ31 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNS3Q9BQ31 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNS3Q9BQ31 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNS3Q9BQ31 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNS3Q9BQ31 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNS3Q9BQ31 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNS3Q9BQ31 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNS3Q9BQ31 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNS3Q9BQ31 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNS3Q9BQ31 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNS3Q9BQ31 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNS3Q9BQ31 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNS3Q9BQ31 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNS3Q9BQ31 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNS3Q9BQ31 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNS3Q9BQ31 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNS3Q9BQ31 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
KCNS3Q9BQ31 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
KCNS3Q9BQ31 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
KCNS3Q9BQ31 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
KCNS3Q9BQ31 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
KCNS3Q9BQ31 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
KCNS3Q9BQ31 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
KCNS3Q9BQ31 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
KCNS3Q9BQ31 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
KCNS3Q9BQ31 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
KCNS3Q9BQ31 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
KCNS3Q9BQ31 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
KCNS3Q9BQ31 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
KCNS3Q9BQ31 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
KCNS3Q9BQ31 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
KCNS3Q9BQ31 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
KCNS3Q9BQ31 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
KCNS3Q9BQ31 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
KCNS3Q9BQ31 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
KCNS3Q9BQ31 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms