Protein–RNA interactions for Protein: Q99466

NOTCH4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 2,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH4Q99466 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NOTCH4Q99466 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms