Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms