Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms