Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCG3Q8WXD2 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCG3Q8WXD2 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCG3Q8WXD2 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCG3Q8WXD2 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCG3Q8WXD2 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCG3Q8WXD2 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCG3Q8WXD2 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCG3Q8WXD2 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCG3Q8WXD2 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCG3Q8WXD2 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCG3Q8WXD2 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCG3Q8WXD2 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCG3Q8WXD2 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCG3Q8WXD2 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCG3Q8WXD2 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCG3Q8WXD2 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCG3Q8WXD2 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCG3Q8WXD2 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCG3Q8WXD2 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCG3Q8WXD2 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCG3Q8WXD2 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCG3Q8WXD2 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCG3Q8WXD2 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCG3Q8WXD2 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCG3Q8WXD2 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCG3Q8WXD2 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCG3Q8WXD2 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCG3Q8WXD2 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCG3Q8WXD2 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCG3Q8WXD2 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCG3Q8WXD2 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCG3Q8WXD2 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCG3Q8WXD2 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCG3Q8WXD2 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCG3Q8WXD2 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCG3Q8WXD2 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCG3Q8WXD2 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCG3Q8WXD2 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCG3Q8WXD2 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCG3Q8WXD2 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SCG3Q8WXD2 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCG3Q8WXD2 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SCG3Q8WXD2 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SCG3Q8WXD2 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCG3Q8WXD2 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCG3Q8WXD2 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCG3Q8WXD2 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCG3Q8WXD2 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCG3Q8WXD2 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCG3Q8WXD2 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SCG3Q8WXD2 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCG3Q8WXD2 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCG3Q8WXD2 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCG3Q8WXD2 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCG3Q8WXD2 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCG3Q8WXD2 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCG3Q8WXD2 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCG3Q8WXD2 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCG3Q8WXD2 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCG3Q8WXD2 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCG3Q8WXD2 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCG3Q8WXD2 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCG3Q8WXD2 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCG3Q8WXD2 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCG3Q8WXD2 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCG3Q8WXD2 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCG3Q8WXD2 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCG3Q8WXD2 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCG3Q8WXD2 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCG3Q8WXD2 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCG3Q8WXD2 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCG3Q8WXD2 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCG3Q8WXD2 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCG3Q8WXD2 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCG3Q8WXD2 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCG3Q8WXD2 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCG3Q8WXD2 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCG3Q8WXD2 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCG3Q8WXD2 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCG3Q8WXD2 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCG3Q8WXD2 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCG3Q8WXD2 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCG3Q8WXD2 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCG3Q8WXD2 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SCG3Q8WXD2 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCG3Q8WXD2 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCG3Q8WXD2 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCG3Q8WXD2 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCG3Q8WXD2 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCG3Q8WXD2 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCG3Q8WXD2 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCG3Q8WXD2 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SCG3Q8WXD2 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCG3Q8WXD2 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SCG3Q8WXD2 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCG3Q8WXD2 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SCG3Q8WXD2 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SCG3Q8WXD2 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCG3Q8WXD2 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
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