Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAT5

NEIL3, Endonuclease 8-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL3Q8TAT5 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NEIL3Q8TAT5 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NEIL3Q8TAT5 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NEIL3Q8TAT5 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NEIL3Q8TAT5 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NEIL3Q8TAT5 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NEIL3Q8TAT5 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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NEIL3Q8TAT5 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NEIL3Q8TAT5 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NEIL3Q8TAT5 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NEIL3Q8TAT5 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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NEIL3Q8TAT5 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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NEIL3Q8TAT5 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NEIL3Q8TAT5 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NEIL3Q8TAT5 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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NEIL3Q8TAT5 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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NEIL3Q8TAT5 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NEIL3Q8TAT5 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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NEIL3Q8TAT5 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NEIL3Q8TAT5 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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NEIL3Q8TAT5 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NEIL3Q8TAT5 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NEIL3Q8TAT5 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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NEIL3Q8TAT5 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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NEIL3Q8TAT5 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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NEIL3Q8TAT5 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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NEIL3Q8TAT5 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NEIL3Q8TAT5 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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NEIL3Q8TAT5 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NEIL3Q8TAT5 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NEIL3Q8TAT5 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEIL3Q8TAT5 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEIL3Q8TAT5 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEIL3Q8TAT5 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEIL3Q8TAT5 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEIL3Q8TAT5 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEIL3Q8TAT5 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEIL3Q8TAT5 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEIL3Q8TAT5 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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