Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC11□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC11□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC11□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms