Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLD3Q8IV08 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLD3Q8IV08 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLD3Q8IV08 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLD3Q8IV08 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLD3Q8IV08 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLD3Q8IV08 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLD3Q8IV08 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLD3Q8IV08 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLD3Q8IV08 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLD3Q8IV08 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLD3Q8IV08 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLD3Q8IV08 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PLD3Q8IV08 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLD3Q8IV08 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLD3Q8IV08 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLD3Q8IV08 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PLD3Q8IV08 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PLD3Q8IV08 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLD3Q8IV08 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLD3Q8IV08 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLD3Q8IV08 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLD3Q8IV08 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLD3Q8IV08 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLD3Q8IV08 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLD3Q8IV08 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLD3Q8IV08 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLD3Q8IV08 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLD3Q8IV08 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PLD3Q8IV08 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLD3Q8IV08 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLD3Q8IV08 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLD3Q8IV08 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLD3Q8IV08 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLD3Q8IV08 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLD3Q8IV08 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLD3Q8IV08 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLD3Q8IV08 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLD3Q8IV08 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLD3Q8IV08 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLD3Q8IV08 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLD3Q8IV08 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLD3Q8IV08 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLD3Q8IV08 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLD3Q8IV08 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLD3Q8IV08 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLD3Q8IV08 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLD3Q8IV08 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLD3Q8IV08 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLD3Q8IV08 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLD3Q8IV08 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLD3Q8IV08 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLD3Q8IV08 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLD3Q8IV08 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLD3Q8IV08 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLD3Q8IV08 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLD3Q8IV08 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLD3Q8IV08 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLD3Q8IV08 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PLD3Q8IV08 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PLD3Q8IV08 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PLD3Q8IV08 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLD3Q8IV08 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLD3Q8IV08 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLD3Q8IV08 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLD3Q8IV08 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PLD3Q8IV08 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLD3Q8IV08 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLD3Q8IV08 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLD3Q8IV08 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLD3Q8IV08 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLD3Q8IV08 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLD3Q8IV08 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLD3Q8IV08 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLD3Q8IV08 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLD3Q8IV08 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLD3Q8IV08 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLD3Q8IV08 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLD3Q8IV08 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLD3Q8IV08 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLD3Q8IV08 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLD3Q8IV08 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLD3Q8IV08 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLD3Q8IV08 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
PLD3Q8IV08 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLD3Q8IV08 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLD3Q8IV08 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLD3Q8IV08 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLD3Q8IV08 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLD3Q8IV08 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLD3Q8IV08 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLD3Q8IV08 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLD3Q8IV08 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PLD3Q8IV08 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLD3Q8IV08 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLD3Q8IV08 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLD3Q8IV08 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLD3Q8IV08 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLD3Q8IV08 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLD3Q8IV08 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms