Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms