Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms