Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms