Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms