Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms