Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
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