Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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ZIC1Q15915 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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ZIC1Q15915 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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ZIC1Q15915 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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ZIC1Q15915 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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ZIC1Q15915 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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ZIC1Q15915 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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