Protein–RNA interactions for Protein: Q15543

TAF13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF13Q15543 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
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TAF13Q15543 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TAF13Q15543 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TAF13Q15543 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
TAF13Q15543 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TAF13Q15543 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TAF13Q15543 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
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TAF13Q15543 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TAF13Q15543 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TAF13Q15543 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TAF13Q15543 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TAF13Q15543 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
TAF13Q15543 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
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TAF13Q15543 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
TAF13Q15543 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
TAF13Q15543 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC14.08□□□□□ -0.15
TAF13Q15543 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
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TAF13Q15543 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TAF13Q15543 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TAF13Q15543 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TAF13Q15543 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TAF13Q15543 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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TAF13Q15543 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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TAF13Q15543 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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TAF13Q15543 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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TAF13Q15543 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TAF13Q15543 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TAF13Q15543 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
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TAF13Q15543 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
TAF13Q15543 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TAF13Q15543 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TAF13Q15543 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TAF13Q15543 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TAF13Q15543 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TAF13Q15543 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
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