Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
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