Protein–RNA interactions for Protein: Q13885

TUBB2A, Tubulin beta-2A chain, humanhuman

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Length 445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2AQ13885 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TUBB2AQ13885 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TUBB2AQ13885 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TUBB2AQ13885 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TUBB2AQ13885 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TUBB2AQ13885 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TUBB2AQ13885 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TUBB2AQ13885 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TUBB2AQ13885 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TUBB2AQ13885 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TUBB2AQ13885 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TUBB2AQ13885 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBB2AQ13885 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBB2AQ13885 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBB2AQ13885 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBB2AQ13885 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBB2AQ13885 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBB2AQ13885 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBB2AQ13885 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBB2AQ13885 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBB2AQ13885 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBB2AQ13885 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBB2AQ13885 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBB2AQ13885 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBB2AQ13885 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBB2AQ13885 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBB2AQ13885 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBB2AQ13885 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBB2AQ13885 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBB2AQ13885 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBB2AQ13885 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBB2AQ13885 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBB2AQ13885 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBB2AQ13885 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBB2AQ13885 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBB2AQ13885 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBB2AQ13885 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBB2AQ13885 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
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TUBB2AQ13885 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBB2AQ13885 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBB2AQ13885 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBB2AQ13885 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBB2AQ13885 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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TUBB2AQ13885 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBB2AQ13885 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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TUBB2AQ13885 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBB2AQ13885 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBB2AQ13885 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBB2AQ13885 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBB2AQ13885 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBB2AQ13885 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBB2AQ13885 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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TUBB2AQ13885 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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TUBB2AQ13885 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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TUBB2AQ13885 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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TUBB2AQ13885 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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TUBB2AQ13885 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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TUBB2AQ13885 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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TUBB2AQ13885 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TUBB2AQ13885 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TUBB2AQ13885 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TUBB2AQ13885 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TUBB2AQ13885 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TUBB2AQ13885 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TUBB2AQ13885 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TUBB2AQ13885 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TUBB2AQ13885 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TUBB2AQ13885 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TUBB2AQ13885 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TUBB2AQ13885 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TUBB2AQ13885 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TUBB2AQ13885 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TUBB2AQ13885 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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