Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
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SHROOM2Q13796 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
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SHROOM2Q13796 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
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