Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
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