Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
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CALCOCO2Q13137 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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CALCOCO2Q13137 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
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CALCOCO2Q13137 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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CALCOCO2Q13137 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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CALCOCO2Q13137 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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