Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms