Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC9.04□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC9.04□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC9.04□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.03□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC9.03□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC9.03□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms