Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms