Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms