Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms