Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
XPCQ01831 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
XPCQ01831 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
XPCQ01831 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
XPCQ01831 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
XPCQ01831 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
XPCQ01831 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
XPCQ01831 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
XPCQ01831 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
XPCQ01831 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
XPCQ01831 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
XPCQ01831 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
XPCQ01831 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
XPCQ01831 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
XPCQ01831 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
XPCQ01831 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
XPCQ01831 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
XPCQ01831 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
XPCQ01831 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
XPCQ01831 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
XPCQ01831 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
XPCQ01831 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
XPCQ01831 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
XPCQ01831 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
XPCQ01831 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
XPCQ01831 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
XPCQ01831 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
XPCQ01831 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
XPCQ01831 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
XPCQ01831 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
XPCQ01831 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
XPCQ01831 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
XPCQ01831 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
XPCQ01831 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
XPCQ01831 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
XPCQ01831 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
XPCQ01831 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
XPCQ01831 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
XPCQ01831 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
XPCQ01831 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
XPCQ01831 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
XPCQ01831 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
XPCQ01831 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
XPCQ01831 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
XPCQ01831 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
XPCQ01831 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
XPCQ01831 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
XPCQ01831 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
XPCQ01831 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
XPCQ01831 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
XPCQ01831 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
XPCQ01831 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
XPCQ01831 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
XPCQ01831 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
XPCQ01831 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
XPCQ01831 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
XPCQ01831 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
XPCQ01831 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
XPCQ01831 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
XPCQ01831 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
XPCQ01831 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
XPCQ01831 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
XPCQ01831 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
XPCQ01831 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
XPCQ01831 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
XPCQ01831 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
XPCQ01831 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
XPCQ01831 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
XPCQ01831 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
XPCQ01831 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
XPCQ01831 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
XPCQ01831 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
XPCQ01831 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
XPCQ01831 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
XPCQ01831 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
XPCQ01831 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
XPCQ01831 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
XPCQ01831 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
XPCQ01831 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
XPCQ01831 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
XPCQ01831 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
XPCQ01831 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
XPCQ01831 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
XPCQ01831 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
XPCQ01831 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
XPCQ01831 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
XPCQ01831 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
XPCQ01831 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
XPCQ01831 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
XPCQ01831 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
XPCQ01831 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
XPCQ01831 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
XPCQ01831 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
XPCQ01831 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
XPCQ01831 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
XPCQ01831 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
XPCQ01831 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
XPCQ01831 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
XPCQ01831 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
XPCQ01831 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms