Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms