Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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FAM3AP98173 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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