Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms